Воспитываясь под руководством своего дяди Джалу Кхенпо Цеванга Ригдзина, Кхен Ринпоче Тхуптен Озер с ранних лет изучал чтение и письмо, а также заучивал наизусть молитвы и ритуальные тексты. Примерно в возрасте четырнадцати лет его дядя, великий Джалупа, направил его на обучение к Кхенпо Тхубге (Тхуптену Чопхелу) и Поба Тулку Донгаку Тенпеи Ньиме. Пробыв учеником Кхенпо Тхубги чуть более года, Ринпоче получил от него обеты новицкого монаха. Затем, проведя почти десятилетие в учебе, он постиг всё философское, практическое и медитативное наследие Владыки Джамгона Мипхама Намгьяла Гьямцо у своего Учителя Прибежища Кунзика Донгака Тенпеи Ньимы.
Позже, уже в изгнании, став наследником великого духовного наследия Мипхама Ринпоче и Донгака Тенпеи Ньимы, Ринпоче стал одним из самых уважаемых и востребованных кхенпо школы Ньингма. На самом деле, если бы не его удивительное знание и понимание взглядов Мипхама, он с радостью провёл бы свои годы в уединённом отшельничестве — сначала в пещерах, а затем в духовном центре, который он и его главный ученик Кхенпо Кончок Монлам построили в долине Паган на севере Индии. Проведя около 13 лет в ретрите в Пагане, Ринпоче оказался окружён учениками и начал давать учения всем тулку, кхенпо, ламам, монахам и монахиням, обращавшимся к нему за наставлениями.
Он стал широко известен благодаря особой доброте и заботе, которую проявлял в обучении монахинь, относившихся к ним наравне с монахами. Ринпоче скончался в сентябре 2000 года. Он остаётся одним из важнейших кхенпо для многих ныне живущих тулку и хранителей линий передачи школы Ньингма.